Dans le monde, il y a deux types d'individus : ceux qui sont dotés de compétences puissantes et les autres. Fate, modeste garde, s'est toujours retrouvé dans la seconde catégorie.
Sous ses airs de lycéen lambda, Cid rêve de devenir un être tirant les ficelles dans l'ombre. Réincar-né dans un monde fantastique, il en profite pour monter une organisation secrète, Shadow Gar-den, dont il est le chef : « l'Éminence de l'Ombre ».
Ayanakôji se retrouve au plus bas de cette école, au sein de la classe des rebus et des méprisés. Accompagné de Suzune Horikita, une élève déterminée à rejoindre la classe A, il va devoir vaincre le système et la concurrence de cette école impitoyable !
Kenichi cherche un nouveau jeu pour le combler, mais tout ce qu'il trouve est bien trop facile. Il tombe sur un jeu sans titre, qui promet un défi incomparable et un potentiel sans précédent. Sans hésiter, il sélectionne la difficulté "Hell Mode".